Cuando los impulsos eléctricos no viajan a través de las vías normales, o más bien, lo hacen con un ritmo anormal, el bombeo de la sangre a través del corazón se ve interrumpido.

Un ejemplo de esto (diagrama a la derecha) es conocido como la Vía Accesoria de  Wolff-Parkinson-White. En este defecto, los impulsos eléctricos llegan al ventrículo derecho o izquierdo a través de dos vías en vez de la normal, causando que la contracción ventricular no se haga en forma sincronizada.

Otros defectos electrofisiológicos que afectan al corazón incluyen varias formas de arritmia, o ritmos irregulares de los latidos del corazón.  Ejemplos de arritmias son la  taquicardia (el corazón late más rápido de lo normal) y la fibrilación (la contracción rápida y caótica de las fibras musculares individuales del corazón). El aleteo o flutter, otro tipo de arritmia, es una forma menos severa de fibrilación.